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基于众包数据和遗传规划算法的农作物遥感智能识别方法

  • 赵立成
  • 刘园
  • 温彩运
  • 张士博
  • 吴清滢
  • 梁社芳
  • 张素心
  • 王淇锋
  • 游振宇
  • 史云
  • 吴文斌
  • 王聪
  • 段玉林
  • 宋茜
  • 陆苗
  • 余强毅
中国农业科学院农业资源与农业区划研究所,北京100081/农业农村部农业遥感重点实验室

最近更新:2022-05-13

DOI:10.12105/j.issn.1672-0423.20220104

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摘要

【目的】

农作物空间分布信息是支撑相关科学研究与政策制定的重要依据。当前农作物空间分布遥感分类在理论和技术方法方面取得了长足的发展,但仍面临一些难题,包括地面样本数据的获取困难、作物特征选择存在主观性和冗余、特征构建过程中缺乏针对性和代表性等,导致农作物空间分布遥感分类的效率与精度不足。

【方法】

针对这些问题,文章开展快速、准确、低成本的样本获取、特定作物分类的最优特征构建与优选,并分别选择多个研究区开展实证研究。样本获取方面,开发基于“视田”众包的样本获取平台,通过迭代更新的任务采集和历史样本库的方式高效获取地面样本。作物分类方面,提出遗传规划算法为不同作物提取差异化的特征,通过遗传进化思想实现定制化特征的构建,能够在原始特征的基础上构建高层次特征。

【结果】

在北方地区,利用“视田”众包工具,由8名工作人员2天内完成了位于义县、辽中区、新民市及开原市4个区域的水稻、玉米、大豆和花生的样本采集,内业工作人员同步进行分类并迭代样本需求,分类的总体精度均大于90%,kappa系数均高于0.87。在南方地区,位于湖北省枝江市区域的春秋两季作物分类结果的总体精度均大于94%,kappa系数均高于0.86。

【结论】

该文提出了一套快速、高效开展农作物遥感分类的技术体系:利用众包采集快速扩大样本数量,同时利用遗传规划算法提高样本训练效率。在不同区域、不同作物类型研究区应用,可实时、准确生产农作物空间分布图,总体效果稳定,在支撑科学研究与政策制定方面具有较强的应用前景。

0 引言

农作物空间分布信息是农作物长势监测、产量估测和灾害评估的重要基础,也是区域农作物种植结构优化调整、水土资源管理和政府宏观决策的重要支撑。遥感因其覆盖范围大、高效及时以及低成本等优点,被广泛应用于农作物空间分布信息提取研究中,为快速、准确获取大区域的农作物空间分布提供了全新的技术手

1-4。近年来随着新一代信息技术与农业学科领域的深度融合,农作物遥感分类无论是在理论、技术方法方面,还是在实践方面都取得了长足发展。然而,农作物分类目前仍存在两大难题:①由于地面样本获取耗时耗力,数据存放分散、不连续,共建共享机制不完善,严重制约了农作物遥感分类的精度和效率。②作物特征选择存在主观性和冗余,特征构建过程中缺乏针对性和代表性,严重影响了农作物分类的准确性及算法的普适性。

作物样本是分析农作物在遥感图像不同波段光谱亮度、空间结构特征的重要输入,其质量、数量以及空间布设直接影响分类效果。作物生长季内,地面观测数量不足、农作物类型不全时有发生,特别是在农作物早期识别中,训练样本的缺失使农作物遥感分类受阻。传统的农作物地面样本采集主要通过实地调研的方法,利用全球定位系统定位,实地记录农作物空间位置信息和农作物类别信息,其优势是可以准确地获得研究区域内较为详细的农作物信息,缺点是需要耗费较多人力、物力和财力,难以实现大区域尺度的样本采集。如美国、加拿大和欧洲等国家和地区已经实现了大区域尺度农作物“一张图”,其中美国农田统计数据(Cropland Data Layer,CDL)产品以高达95%的精度实现国家全覆盖;年度作物清单也可以覆盖加拿大南部的六大省份且精度超过85%

5-6;Sen2-Agri automated system耕地的总体精度也高达90%,作物的总体精度>80%。但是这些产品都依赖于农户上传数据,得益于完备的农业调查统计体系,花费成本极高,且发布日期滞后,在我国目前难以实现。如何能快速、准确、低成本地获取作物生长季且具有代表性的样本,建立样本数据库解决样本对分类的限制亟待解决的问题。

特征是农作物遥感分类的重要基础,目前分类器的设计已经相对成熟,当前工作的重点是特征提取策略研

4,特征选择的准确性和代表性对分类精度有显著影响。研究中常用的分类特征有光谱、植被指数、纹理和物候特征等,能够表征和突出一定作物季相规律和物候期信息,根据作物在遥感影像上的特征值及其随时间变化的特性实现作物分类。现在越来越多的要素被加入到分类特征中,但是引入过多的特征有时候会适得其反形成“维数灾难”,更多的特征数量并不意味着会获取更多有用的分类信息,冗余的特征信息不但不会增加精度,反而会增加模型的复杂度从而降低模型运算的效7。另一方面特征选择具有一定主观性,难以全面地提供农作物信息,导致算法难以有效地识别不同农作物特征进而影响分类精度。而且在可用数据有限的条件下,遥感影像提取的特征缺失了时间上的连续性,难以充分体现不同农作物的差异,实现高精度农作物分类。随着机器学习算法的不断改进,深度学习算法逐渐被引入到农作物遥感分类1,该算法通过构建学习网络,可以自主训练出不同农作物的特征进而实现分类,但是需要大量的样本输入完成神经网络的训5,同时构建的高层特征不具备可解释性,从而难以实现在作物分类上的广泛应用,深度学习在模型迁移上仍然处于探索阶段。目前针对特定作物的最优特征研究也较少,如何在不增加样本输入的条件下,解决针对特定作物分类的最优特征构建与优选也是值得探索的方向。针对这些问题,文章开展了快速、准确、低成本的样本获取方案,以及特定作物分类的最优特征构建与优选,并分别选择多个研究区开展实证研究,为农作物空间分布遥感分类在样本获取和特征构建方面提供了支撑。

1 研究区及数据

1.1 研究区概况

研究区域选择了我国南北方种植类型不同的辽宁省和湖北省共5个区域,其中辽宁省包括4个小区(图1A),主要农作物为水稻、玉米、大豆、花生等,熟制为一年一熟,生育期为4—10月。湖北省所选小区位于枝江市(图1B),主要农作物为柑橘、水稻、小麦、玉米、油菜等。研究区农作物熟制为一年两熟,主要是小麦/油菜与玉米/水稻轮作。柑橘生育期为2—10月,中稻及一季晚稻生育期为5—10月,小麦与油菜生育期较为相似为9月至次年5月,玉米生育期为5—9月。

图1  研究区区位

Fig.1  Location map of the study area

1.2 研究数据

影像数据来源于哨兵2号(Sentinel-2)高分辨率多光谱成像卫星,其携带一枚多光谱成像仪(MultiSpectral Instrument,MSI),用于陆地监测,可提供植被、土壤和水覆盖、内陆水路及海岸区域等图像。

北方地区,该文基于Google Earth Engine(GEE)平台筛选出2020年4—11月义县、新民市、辽中区、开原市4个区域云量较少的哨兵2号影像共28幅,然后选择临近日期的影像进行镶嵌处理,每个地区处理后得到间隔约为1个月的影像集。南方地区,选出枝江市2020年5—10月的哨兵2号可用影像共计5景,用于研究区水稻、玉米的分类;2020年10月至2021年6月可用影像共计7景,用于研究区小麦、油菜的分类;柑橘为多年生作物,故采用整年的影像进行分类。

2 研究方法

2.1 方法概况

为解决样本获取和特征构建问题,提出了基于众包数据采集和遗传规划定制化特征构建的农作物遥感分类方法,主要包括样本获取、作物分类两个部分(图2)。首先,基于“视田”平台可高效获取地面样本。通过“视田”Web端发布任务,发动当地学生、农民等完成样点采集,可快速获得高时效的地面样本。随着“视田”的推广,逐渐形成了数量可观的历史样本库,通过时空迁移方法,可获得大量可靠的地面样本信息。其次,基于遗传规划算法可为不同作物提取差异化的特征,实现作物定制化特征的自动提取,有效提升分类精度。由于水体、建筑、柑橘的光谱纹理等特征与其他作物差异显著,采用分层提取方法完成作物分类,进一步提升分类精度。最后,利用eCognition对哨兵2号影像进行多尺度分割,并基于分割单元对分类结果作平滑处理。平滑处理不仅能减少分类结果的“椒盐”现象,还可降低细碎像元错误分类带来的误差。

图2  总体技术路线

Fig.2  Overall technology roadmap

2.2 样本获取

实时、准确、精细获取农田信息是加快推动农业信息化管理的基础,但由于农田信息变化快、时空差异大,传统技术手段很难满足信息获取需求。“视田”通过众包的手段,成本低廉、操作简单,为农田信息采集提供全新解决思路,主要包括两个功能模块。

(1)网页端(图3左),主要功能为发布样本采集任务和下载采集的样本数据。通过研究区域非监督分类计算作物分布空间异质性并成比例生成采集任务点分布,并结合遥感影像数据加载至“视田”平台,进行任务发布(图4)。

图3  “视田”网页端发布任务(左)及APP端采集样本(右)

Fig.3  Publishing tasks on the web (left) and samples collected on the “Shitian” APP (right)

图4  遥感影像数据加载

Fig.4  Remote sensing data overlay

(2)移动端(即基于智能手机的农田信息采集APP,图3右),能够访问智能手机的GPS、时钟、通讯、摄像头等组件,用户通过APP拍摄照片的方式记录作物种植类型,通过调动GPS位置信息,确定采样地点。农田信息与时空位置信息自动关联,并通过用户账号自动上传云平台进行数据管理。

为快速完成样点采集工作,通过非监督分类对研究区域作物分布空间异质性进行计算并成比例生成采集任务点,将生成的任务点通过“视田”众包平台网页端进行发布(图3左)。利用“视田”APP端(图3右)进行样本采集。基于此,研究通过两天时间高效地获得4个研究区地面样本点共572个,如图5所示。

图5  辽宁区域地面样本在“视田”中的空间分布

Fig.5  Spatial distribution of ground samples in the “Shitian” in Liaoning region

对于湖北区域,利用“视田”的历史样本库中存有2021年潜江市和仙桃市水稻、小麦、油菜和玉米共120个样本点,以及2019年广西的839个柑橘样本点,根据作物光谱、时相及纹理特征,完成样本的时空迁移。最终,柑橘、玉米、油菜、水稻、小麦分别获得50个、137个、27个、52个、100个样本点,其他类(水体、林地、建筑、其他作物)约700个。

2.3 特征构建

2.3.1 基础特征

植被指数可以综合植被在不同波段的反射特性,很好地反映作物的生长状况,因而被广泛地应用于农作物分类和长势监测中。通过对遥感影像不同波段进行线性组合,得到的植被指数能反映不同作物生物物理特性的差异,增强农作物信息的特征表达。选用9个常用的植被指数和7个纹理特征(表1)。

表1  农作物分类的输入特征
Table 1  Input features for crop classification
类别特征
光谱特征 B2-B8、B8A、B11、B12
植被指数特征 VI8、NDVI9、NDTI10、NDSVI11、LSWI12、EVI7、RESI13、RENDVI14、NDPI15
纹理特征 角二阶矩、对比度、相关性、方差、逆差矩、熵和相异性

2.3.2 定制化特征

定制化特征即针对不同作物构建差异化的特征,使用所有的作物特征进行作物多分类。由于作物间的物候历较为相似,“同物异谱”和“同谱异物”现象严重,同质性的作物特征并不能有效区分相似作物,对此定制化特征具有较大的潜力。遗传规划算法可以实现定制化特征的构建,其基本思想是仿效自然界中生物遗传和进化的过程,随机产生一个适合给定环境的初始种群,种群中的每个个体都代表问题的一个解决方

16。在计算每个个体的适应度之后,通过复制、交叉和变异等遗传算子得到新的个体,以实现种群的进化(图6)。

图6  遗传规划算法的进化流程

Fig.6  Evolutionary process of genetic programming algorithm

迭代上述过程,直到得到问题的最优解或者达到最大迭代次数,其得到的新特征具有一定可解释性和可视化。遗传规划算法能够在原始特征的基础上构建高层次特征,改善分类效果,并且可以可视化特征进化的过程,具有一定的可解释性,针对不同的作物分别构建遗传规划算法特征,最后一起输入随机森林实现作物的多分类。图7所展示的是遗传规划为枝江市定制的玉米特征,数学表达式为:

sinB11-sinB8A-cosB4+-0.18+B11×-0.18+B5-B4-B2 (1)

图7  开原市区域大豆遗传规划算法特征

Fig.7  Features of genetic programming algorithm for soybeansin the autumn of 2020 in Kaiyuan region

2.4 分类方法

图8所示,基于时空迁移得到的样本点及遗传规划算法构建的定制化作物特征,采用分层提取策略,利用随机森林分类器完成作物分类。分层提取方法被广泛应用于各类土地覆盖信息提取,即根据各类目标的不同特征,采取相应的信息提取方法,分别建立专题信息层,最后把各专题层合并得到整体分类图。分层提取能够有效地排除和避免提取地物时多余信息的干扰和影响,目标明确。分层提取也有利于对分类结果的灵活处理,对地物的合并和进一步划分较为简便,方便用户根据研究区域的特点和模型需求划分所需的地物类型。

图8  作物分类方法流程

Fig.8  Flow chart of crop classification method

以湖北区域为例的分层作物提取流程如下:①基于水体、建筑物、道路等非耕地样本,结合遗传规划算法自动提取的特征,进行第一次分类得到研究区内非耕地掩膜,以排除非耕地像素对作物提取的干扰,生成耕地图层;②通过时空迁移收集柑橘样本,并采用全年时间序列的影像,结合遗传规划算法在耕地区域内提取柑橘,并制作柑橘掩摸,生成下一步待分类区域;③经由前两步掩摸提取后生成待分类区域,在其中进行剩余两种农作物的分类。通过时空迁移收集样本,结合遗传规划算法完成分类。居民区的行道树是干扰柑橘分类的一类典型植物,通过先一步提取居住区再掩膜之后,很好地改善了将行道树错分成柑橘的情况。

获得作物分布图后,对分类结果进行面向对象的后处理。使用10 m分辨率的Sentinel-2影像进行多尺度分割,以生成的地块边界为基准过滤分类结果,排除掉了分类结果中存在的异常点,使得田块的边界更为清晰规整。处理后的结果更符合实际情况,有助于提升分类精度。

3 研究结果

3.1 辽宁区域作物分类结果

基于样本点和时序遥感影像,利用遗传规划算法自动构建作物的定制化特征,依照分层提取策略,分别对义县、辽中区、新民市及开原市4个区域的水稻、玉米、大豆、花生进行分类,结果如图9所示,各区域内农作物分类的整体精度均大于90%,kappa系数均高于0.87(表2),该结果表明,基于遗传规划算法的农作物分类效果具有较高的精度。

图9  辽宁省区域作物分类

Fig.9  Liaoning regional crop classification

表2  基于最佳时相的辽宁区域农作物分类精度
Table 2  Classification accuracy of crops in Liaoning region based on optimal time phase
区域OA(%)Kappa水稻(%)玉米(%)大豆(%)花生(%)
辽中区 95.07 0.93 100 94 80 100
开原市 90.48 0.87 100 97 70
义县 91.40 0.88 86 100 92
新民市 92.56 0.89 83

注:  “-”代表该区域无对应作物

从分类结果看(图9),4个区域的不同农作物的种植面积差异较大。辽中区以水稻种植为主,种植面积为4 483 ha,其次是玉米、大豆和花生,种植面积分别为2 912 ha、912 ha和168 ha。开原市以玉米种植为主,面积为9 128 ha。其次是大豆和水稻,种植面积分别为1 129 ha和652 ha。义县的玉米播种面积最大,为6 174 ha,其次是花生和大豆,种植面积分别为3 797 ha和149 ha。新民市以水稻种植为主,播种面积为8 062 ha。其次为玉米和大豆,种植面积分别为2 834 ha和616 ha。

3.2 湖北区域作物分类结果

基于样本点和时序遥感影像,利用遗传规划算法自动构建作物的定制化特征,依照分层提取策略,对枝江市研究区的柑橘、油菜、小麦、水稻、玉米进行分类。结合当地轮作情况,制作不同时相的分类结果图两张(图10a、b)。其中,2020年秋季涉及的作物类型为柑橘、玉米、水稻,2021年春季涉及的作物类型为柑橘、油菜、小麦。两次分类结果的作物分类的整体精度均大于94%,kappa系数均高于0.86(表3),该结果表明,基于遗传规划算法的农作物分类效果具有较高的可信度。从2020年秋季结果(图10a)看,玉米为此时期研究区内主要种植的作物,种植面积为2 529 ha,占研究区总面积45.29%,其次是水稻、柑橘,种植面积均为289 ha,占比为5.18%。玉米在研究区内集中且成片分布,占据大部分旱地;水稻多分布于研究区中部与西部地区;柑橘则主要在研究区中上部与东南部地区有较为密集的分布。从2021年春季结果(图10b)看,小麦为此时期研究区内主要种植的作物,种植面积为2 265 ha,占研究区总面积40.55%,其次是油菜、柑橘,种植面积分别为553 ha、289 ha,占比分别为9.91%、5.18%。小麦的分布情况与玉米相似,但总面积略少于玉米;油菜的空间分布比较均匀,且油菜和小麦的生长期十分相近,在图10b中可以观察到小麦与油菜间作种植的情况;柑橘分布情况同图10a。对比两张分类结果图,可以观察到种植油菜/小麦的地块转变为种植玉米/水稻,与当地的轮作情况一致。

图10  湖北区域作物分类。a. 2020年秋季,b. 2021年春季

Fig.10  Classification results in Hubei region of autumn crops in 2020 and spring crops in 2021

表3  基于分层提取的湖北区域农作物分类精度
Table 3  Classification accuracy of crops in Hubei region based on stratified extraction
OA(%)Kappa柑橘(%)玉米(%)水稻(%)小麦(%)油菜(%)
2020年秋季 94.04 0.86 86.67 95.12 75.00
2021年春季 95.49 0.88 86.67 100.00 87.50

注:  “-”代表该区域无对应作物

4 讨论

农作物特征获取是农作物分类的关键,传统算法对特定区域的作物特征获取有较好的表现。但由于南北方气候、种植结构、种植类型等的较大差异,使得传统算法难以迁移。为了验证方法的可靠性,以辽宁省开原市研究区为例,该文设计了3组对照试验,对比了多时相和单时相两个情景来验证研究算法的优势。①将哨兵2号时间序列数据中的10个原始光谱波段作为特征,输入随机森林分类器中进行分类;②将哨兵2号时间序列数据的10个原始光谱波段作为特征输入遗传规划算法中,通过进化计算筛选出20个遗传规划特征,将20个遗传规划特征输入到随机森林分类器中进行分类;③将光谱特征、植被指数、纹理特征一并输入到随机森林分类器中进行分类。

4.1 基于多时相的农作物分类对比

在影像充足的情况下,研究收集了作物生长季中所有可用的影像进行农作物分类,3组试验的结果如表4。总体来看,3个实验在辽宁开原市的总体精度都在96%以上,但基于遗传规划特征的方案精度最高,证明遗传规划算法构建的定制化特征不仅比原始光谱特征好,而且优于人工提取的植被指数+纹理特征。从特征数量的角度看,遗传规划算法仅需要20个特征就可以达到97.62%的精度,极大降低了参数,节约了计算成本和资源消耗。

表4  基于多时相的辽宁开原市研究区分类精度
Table 4  Classification accuracy of Kaiyuan area based on multi-temporal
特征数量(个)OA(%)Kappa水稻(%)玉米(%)大豆(%)花生(%)
光谱特征 70 96.83 0.96 100 97 90 98
遗传规划 20 97.62 0.97 100 97 95 98
光谱+植被指数+纹理特征 182 96.80 0.96 100 97 90 98

4.2 基于单时相的农作物分类对比

卫星数据的质量受到天气影响的制约,对于指定的研究区域很有可能无法获取到足量的卫星数据用于遥感分类研究,因此在数据时相不足时的分类表现至关重要。此外,即使在数据量充足的地区,减少数据的使用量也能够显著的节约计算成本和资源消耗。因此提出一种在少时相数据下稳定表现的农作物分类方法具有重要意义。研究以辽宁开原市为例,对比了基于遗传规划的农作物自动分类方案在不同时相数据的稳定性。

计算不同特征可分离性指数的平均值进行排序(表5),其中排名第一的是6月份,即农作物特征信息量最丰富的是6个月份的影像,为最佳分类时相。得分最低的是4月份,即数据包含农作物特征信息量最少的时相是4月份,为最差分类时相。在最佳时相(6月)数据和最差时相(4月)的分类结果较为一致,分类精度最高的是基于遗传规划构建的特征的分类方法,其次是人工提取特征的分类精度,分类结果最差的为仅使用光谱波段作为输入的分类结果(表67)。

表5  各月份哨兵2号数据的辽宁开原市研究区可分离性指数权重得分
Table 5  Kaiyuan Separability index weight score of Sentinel- 2 data in each month
月份得分
6 2 111.75
8 1 444.39
7 1 241.58
10 833.16
9 650.48
5 489.34
4 196.54
表6  基于6月单时相哨兵数据的辽宁开原市研究区分类精度
Table 6  Classification accuracy of Kaiyuan area based on single-phase sentinel data in June
特征数量(个)OA(%)Kappa水稻(%)玉米(%)大豆(%)
光谱特征 10 87.30 0.82 96 90 70
遗传规划特征 20 90.48 0.87 100 97 70
光谱+植被指数+纹理特征 26 89.68 0.86 100 95 70
表7  基于4月单时相哨兵数据的辽宁开原市研究区分类精度
Table 7  Classification accuracy of Kaiyuan area based on single-temporal sentinel data in April
特征数量(个)OA(%)Kappa水稻(%)玉米(%)大豆(%)
光谱特征 10 65.87 0.52 58 72 20
遗传规划特征 20 74.60 0.65 71 85 15
光谱+植被指数+纹理特征 26 70.63 0.59 67 67 30

5 结论

该文针对目前农作物遥感分类中样本数据获取困难和作物特征选择存在主观性和冗余性的问题。提出了基于“视田”众包的样本获取方案,可通过迭代更新的任务采集和历史样本库的方式高效获取地面样本。提出的遗传规划算法可为不同作物提取差异化的特征,通过对原始影像进行自动学习,能够在原始特征的基础上构建高层次特征。通过在南北方5种不同作物种植类型的研究区域的实验表明,该文方案一方面可以提高分类方法的普适性和分类精度,另一方面在可用数据丰富和匮乏的情况下,都能有较为稳定的优秀表现。

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